CircaKB

CircaKB is a knowledgebase providing systematic genome-wide annotations of oscillatory gene expression patterns across 15 species, integrating 226 time-course transcriptome datasets from diverse tissues/organs. It offers 12 computational models for identifying circadian variations and supports custom analysis through search, visualization, and data upload tools.

CircaKB是一款知识库，可为15个物种的节律性基因表达模式提供系统性全基因组注释，同时整合了来自多样组织/器官的226套时序转录组数据集。该知识库提供12种用于识别昼夜节律变化的计算模型，并通过搜索、可视化与数据上传工具支持自定义分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CircaKB是一个综合性的昼夜节律基因知识库，涵盖15种生物体的226个时间序列转录组数据集，包含5577个样本，并提供12种计算模型的在线分析功能。