CD34+ human bone marrow

scRNA-seq dataset early human hematopoiesis (CD34+ bone marrow cells) assayed using 10x chromium. Total cell number is 5,780. <br> This dataset contains raw spliced and unspliced counts estimated using the velocyto pipeline (La Manno et al., Nature 2018) that can be used to compute RNA velocity. Further, the dataset contains a precomputed Palantir pseudotime (Setty et al., Nature Biotechnology 2019). <br> Please cite the original publication: https://doi.org/10.1038/s41587-019-0068-4

本数据集为采用10x Chromium平台检测的人类早期造血过程单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing，scRNA-seq）数据集，样本为CD34阳性骨髓细胞，总细胞数为5780个。
本数据集包含通过velocyto分析流程（La Manno等，《自然》，2018年）估算得到的原始剪接计数与未剪接计数，可用于计算RNA速率（RNA velocity）。此外，本数据集还包含预先计算完成的Palantir伪时间轨迹（Setty等，《自然·生物技术》，2019年）。
请引用该数据集的原始文献：https://doi.org/10.1038/s41587-019-0068-4

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集包含5,780个CD34+人类骨髓细胞的scRNA-seq数据，使用10x chromium技术生成，提供了用于RNA速度计算的原始计数和预计算的Palantir伪时间。数据集适用于早期人类造血研究和轨迹推断分析。