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Linum trigynum - PI estimates per population

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figshare.scilifelab.se2024-10-30 更新2025-03-26 收录
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Whole genome pi estimates for individuals of all population of L. trigynum per 100 kb windows.It is part of this article: Gutiérrez-Valencia, J., Zervakis, P. I., Postel, Z., Fracassetti, M., Losvik, A., Mehrabi, S., ... & Slotte, T. (2024). Genetic causes and genomic consequences of breakdown of distyly in Linum trigynum. Molecular Biology and Evolution, msae087. https://doi.org/10.1093/molbev/msae087Estimations were done using vcftools v.0.1.16 on a filtered vcf file. File's descriptions:CHROM = the chromosome's nameSTART = the start position of the 100 kb windowEND = the end position of the 100 kb windowPI = the estimated value of pi for that windowList of the populations: population 01population 03population 04population 06population 07population 08population 10population 11

针对 L. trigynum 各种群个体全基因组 π 估计值,按每 100 kb 窗口统计。该数据集收录于 Gutierrez-Valencia 等人(2024)撰写的文章《Linum trigynum 分枝性崩溃的遗传原因与基因组后果》中。研究采用 vcftools v.0.1.16 版本在筛选后的 vcf 文件上进行了估计。文件描述如下: CHROM = 染色体名称 START = 100 kb 窗口的起始位置 END = 100 kb 窗口的结束位置 PI = 该窗口 π 估计值 种群列表:种群 01、种群 03、种群 04、种群 06、种群 07、种群 08、种群 10、种群 11。
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