PDBeFold

(i) supersecondary structural motifs (attractors in fold space), (ii) the topology of globular domains (fold types), (iii) remote homologues (functional families) and (iv) homologues with sequence identity above 25% (sequence families).

(i) 超二级结构基序（supersecondary structural motifs，折叠空间中的吸引子）, (ii) 球状结构域的拓扑结构（the topology of globular domains，折叠类型（fold types））, (iii) 远程同源物（remote homologues，功能家族（functional families））, (iv) 序列一致性≥25%的同源物（homologues with sequence identity above 25%，序列家族（sequence families））

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

PDBeFold是一个专注于蛋白质结构相似性比较和3D对齐的数据集，支持单对和多对结构比较，并能与PDB或SCOP存档进行全库比对。该工具还提供结构下载、可视化及与其他生物信息学服务的链接功能。