基因组甲基化程度原始数据集

植物非编码RNA可以介导RNA指导的DNA甲基化途径，通过靶标位点的DNA甲基化完成转录水平的基因沉默。本项目中对于若干植物RNA指导的DNA甲基化调控因子开展了深入研究，这些因子的变化会造成基因组上全局或部分位点的DNA甲基化变化，需要用全基因组甲基化测序技术测定，目前最广泛的DNA甲基化检测技术就是重亚硫酸盐测序技术。本数据集元数据主要为项目开展过程中所产生的重亚硫酸盐测序数据。数据在项目执行期内（2016年至2018年间）产生，主要利用中国科学院上海植物逆境生物学研究中心基因组学平台Illumina HiSeq2000设备产生。数据产生过程中，利用重亚硫酸盐转化率、文库分布、数据冗余度和比对率等参数进行质量监控。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集为植物非编码RNA介导基因沉默研究中产生的基因组甲基化原始数据，采用重亚硫酸盐测序技术，于2016年至2018年间通过Illumina HiSeq2000设备生成，并经过严格的质量监控。数据包含13.77GB的BAM格式文件，用于分析RNA指导的DNA甲基化调控因子变化。