Genomic Expression Archive

Genomic Expression Archive (GEA) is a public database of functional genomics data such as gene expression, epigenetics and genotyping SNP array. Both microarray- and sequence-based data are accepted in the MAGE-TAB format in compliance with MIAME and MINSEQE guidelines, respectively. GEA issues accession numbers, E-GEAD-n to experiment and A-GEAD-n to array design. Data exchange between GEA and EBI ArrayExpress is planned.

基因组表达档案（GEA）是一个公开的基因组学功能数据数据库，其中包含了基因表达、表观遗传学和基因分型单核苷酸多态性（SNP）阵列等数据。该档案接受基于微阵列和序列数据的MAGE-TAB格式，分别遵循MIAME和MINSEQE指南。GEA为实验分配E-GEAD-n编号，为阵列设计分配A-GEAD-n编号。GEA与EBI ArrayExpress之间的数据交换计划正在进行中。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Genomic Expression Archive (GEA)是一个公共功能基因组学数据库，收录基因表达、表观遗传学和SNP基因分型等数据，支持微阵列和基于序列的数据提交，遵循MIAME和MINSEQE指南。GEA由国际核苷酸序列数据库协作组织（INSDC）和日本国立遗传学研究所（NIG）共同支持，数据开放访问，部分数据可能受到限制或延迟公开。