Neurofilament Degradome Atlas (NDA)

(I) A compressed ASCII encoded archive (NDA-all-datasets.tar.gz) which contains 5 datasets:The Neurofilament Degradome Atlas (NDA-dataset.txt): this is the basic dataset for the NDA. This is an ASCII, tab delimited, text file. The dataset contains the NDA IDs with their peptide sequences, protein properties calculated for ready use. All Neurofilament Degradome Atlas IDs reviewed in the validation study are tagged to the respective PRIDE repositories.NDA_self_matches: all self-matches in the NDA by BLAST+.NDA_non_self_matches: all non-self matches of the NDA with the SwissProt database.The unique NDA sequences for HSP.The unique NDA sequences for PD.(II) A compressed archive (NDA-codes-python.tar.gz) which contains the phyton codes for creation of the NDA from the FASTA sequences for each of the 5 Nf isoforms: NfH, NfM, NfL, INA, PRP.

（I）一个压缩的 ASCII 编码存档（NDA-all-datasets.tar.gz），其中包含 5 个数据集：神经丝降解图谱（NDA-dataset.txt）：这是 NDA 的基本数据集。该数据集为 ASCII 格式、以制表符分隔的文本文件，包含 NDA 标识符及其肽序列，以及为方便使用而计算出的蛋白质属性。在验证研究中审查的所有神经丝降解图谱标识符均标记至相应的 PRIDE 存储库。NDA_self_matches：通过 BLAST+ 找到的 NDA 中的所有自身匹配。NDA_non_self_matches：NDA 与 SwissProt 数据库的所有非自身匹配。HSP 的独特 NDA 序列。PD 的独特 NDA 序列。（II）一个压缩存档（NDA-codes-python.tar.gz），其中包含用于从每个 5 个神经丝异构体（NfH、NfM、NfL、INA、PRP）的 FASTA 序列创建 NDA 的 Python 代码。