β-LacFamPred

β-LacFamPred used for prediction and annotation of Ambler's class, subclass and 96 family of beta-lactamase (BLs) into proteins/genes sequences with complete annotation. This method was based on profile Hidden Markov Models (pHMM) which is a probalistic method it includes evolutionary information (MSA) of each family also it facilitated with detailed annotation.β-LacFamPred 可用于对蛋白质或基因序列中的β-内酰胺酶（beta-lactamase, BLs）进行Ambler分类、亚类及96个家族的预测与注释，实现完整注释。该方法基于轮廓隐马尔可夫模型（profile Hidden Markov Models, pHMM），属于概率性建模方法，纳入了各家族的进化信息（多序列比对Multiple Sequence Alignment, MSA），同时可提供精细化注释。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

β-LacFamPred是一个基于隐马尔可夫模型（pHMM）的预测工具，用于对β-内酰胺酶的Ambler类别、亚类和96个家族进行注释和预测。该工具通过进化信息（MSA）实现详细注释，其性能经留一法交叉验证评估，并提供免费学术使用。