CIS-BP

The Catalog of Inferred Sequence Binding Preferences (CIS-BP) is a library of transcription factor (TF) DNA binding motifs and specificities. The data are organized in a user friendly manner for ease of searching, browsing, and downloading. CIS-BP also includes built-in web tools for scanning DNA sequences for putative TF binding sites, predicting the DNA binding motif of a given TF, and identifying a TF that might recognize a given DNA motif.

《推断序列结合偏好目录》（CIS-BP）是一套转录因子（TF）DNA结合基序及其特异性的库。数据按照便于搜索、浏览和下载的方式组织。CIS-BP还内置了网络工具，用于扫描DNA序列以识别潜在的TF结合位点，预测特定TF的DNA结合基序，以及识别可能识别给定DNA基序的TF。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CIS-BP（Catalog of Inferred Sequence Binding Preferences）是一个专注于生命科学领域的转录因子DNA结合基序和特异性数据库，提供用户友好的搜索、浏览和下载功能，并内置网络工具用于DNA序列扫描和基序预测。该数据集规模较大，包含来自741个物种的321个家族的超过39万个转录因子，其中约16.5万个具有至少一个结合基序，强调了其在基因组学和转录调控研究中的实用性和广泛覆盖性。