POLYA
收藏国家生物信息中心2025-10-11 更新2025-03-15 收录
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资源简介：
PolyA_DB version 3.1 catalogs polyA sites (PASs) in genomes using deep sequencing data.Gene annotations are mainly based on NCBI Gene and RefSeq databases, and supplemented by the Ensembl database. Strand-specific RNA-seq data are used to extend the 3' end of genes. PASs are identified using data from the 3' end region extraction and sequencing (3'READS) method. Syntenic regions across human, mouse and rat are used to annotate conserved PASs in mammals.
PolyA数据库（PolyA_DB）版本3.1依托深度测序数据，系统性收录了基因组中的多聚腺苷酸化位点（polyA sites, PAS）。其基因注释主要基于NCBI Gene与RefSeq数据库，并辅以Ensembl数据库。研究人员使用链特异性RNA测序（strand-specific RNA-seq）数据延伸基因的3'端。多聚腺苷酸化位点（PAS）通过3'端区域提取测序（3'READS）方法产生的数据完成鉴定。研究团队借助人类、小鼠和大鼠的跨物种共线性区域（syntenic regions），实现了哺乳动物中保守多聚腺苷酸化位点的注释。
提供机构：
Rutgers New Jersey Medical School and Rutgers Cancer Institute of New Jersey
创建时间：
2018-01-28
搜集汇总
背景与挑战
背景概述
POLYA数据集（PolyA_DB version 3.1）是一个专注于多聚腺苷酸化位点（PASs）编目的资源，整合了多种基因注释数据和测序技术，特别关注哺乳动物中的保守PASs。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
