CSPBENCH|晶体结构预测数据集|算法评估数据集

CSPBENCH数据集由南卡罗来纳大学开发，专门用于晶体结构预测（CSP）领域的算法评估。该数据集包含180个精心挑选的晶体结构，涵盖多种算法类型，如基于模板的CSP算法、基于机器学习的CSP算法等。数据集的创建过程结合了多种优化算法和机器学习技术，旨在通过量化性能指标来评估和比较不同CSP算法的准确性和效率。CSPBENCH数据集的应用领域广泛，主要用于新材料发现，特别是在需要精确预测晶体结构以指导材料设计和工业应用的场景中。

原始信息汇总

CSPBenchmark: 晶体结构预测算法基准

主要晶体结构预测软件概述

算法	年份	类别	开源	URL 链接	编程语言
USPEX	2006	De novo (DFT)	否	link	Matlab
CALYPSO*	2010	De novo (DFT)	否	link	Python
ParetoCSP*	2024	MOGA+MLP	是	link	Python
GNOA*	2022	BO/PSO + MLP	是	link	Python
TCSP*	2022	Template	是	link	Python
CSPML*	2022	Template	是	link	Python
GATor	2018	GA + FHI potential	是	link	Python
AiRss	2011	Random + DFT or pair Potential	是	link	Fortran
GOFEE	2020	ActiveLearning + Gaussian Pot.	是	link	Python
AGOX*	2022	Search + Gaussian Potential	是	link	Python
GASP	2007	GA + DFT	是	link	Java
M3GNet	2022	Relax with MLP	是	link	Python
ASLA	2020	NN + RL	否	link	N/A
CrySPY	2023	GA/BO + DFT	是	link	Python
XtalOpt	2011	GA + DFT	是	link	C++
AlphaCrystal*	2023	GA + DL	是	link	Python

晶体结构预测算法在所有测试结构上的性能比较

使用来自 CSPBenchMetrics 的晶体结构预测性能指标。

排名分数计算代码显示在代码文件夹 Compute-Ranking-Scores。

CSPML、ParetoCSP、AGOX-pt 和 CALYPSO 算法的指标距离

算法	CSPML		ParetoCSP		AGOX-pt		CALYPSO
测试样本	ED	HD	ED	HD	ED	HD	ED	HD
Ca3SnO	0.01	0.02	0.01	0.02	5.50	9.34	0.01	2.41
CoNiSn	34.15	4.33	0.01	0.06	7.26	7.30	34.55	6.68
CoTe	0.18	1.52	0.20	2.33	6.88	9.90	0.11	2.38
Cr3Ga	31.78	2.79	0.12	1.62	11.95	6.62	16.13	4.07
Hf2Ni	0.05	5.58	52.93	3.40	10.94	8.03	0.09	4.18
HfCo2Sn	0.01	0.04	0.15	5.29	5.18	8.88	29.31	3.46
HfMn2	0.03	0.15	59.73	5.53	19.92	7.21	116.21	5.04
InHg	22.54	8.61	0.14	6.05	0.38	7.13	0.02	4.51
Li2CuSn	0.44	0.12	0.05	5.51	2.82	8.76	13.14	3.54
LiMg2Ga	0.00	0.03	0.13	4.48	8.70	8.87	8.60	5.33
MgCu4Sn	0.04	0.09	0.51	2.74	5.65	8.83	67.92	5.34
MgInCu4	0.06	3.07	0.47	3.69	5.92	9.65	20.48	7.26
NaGa4	0.05	5.22	0.05	2.10	3.52	7.42	0.10	2.24
ScCu	0.00	0.01	0.00	0.01	5.39	11.77	0.01	1.70
SrGa4	0.02	5.43	0.05	2.27	4.10	9.97	15.76	6.41
SrGaCu2	0.78	4.79	0.30	9.45	3.27	8.55	13.91	10.39
Ti2Cd	16.18	2.04	0.03	1.46	7.49	9.34	16.66	3.57
TiGa3	0.02	2.44	0.01	1.50	1.48	9.60	0.09	2.67
YAl3	19.39	11.76	1.41	12.24	10.72	9.55	38.98	13.77
YHg2	8.41	5.83	0.02	1.74	3.07	8.98	0.00	1.75
ZnCdPt2	0.29	2.99	0.04	2.04	4.85	8.63	0.03	0.13
ZnCO3	0.08	1.31	8.88	4.71	6.79	8.53	0.54	4.06
ZrHg	9.16	2.69	0.06	2.15	3.09	9.45	9.21	2.30
# of Best	12	11	10	8	1	2	5	3

所有算法的参数和配置

参数和配置的详细信息显示在图像 parameters1.png。

本工作中使用的180个基准晶体的详细信息

测试数据可在 CSPbenchmark_test_data.csv 下载。

材料ID	原始公式	站点数量	空间群	晶系	类别
mp-2334	DyCu	2	221	Cubic	binary_easy
mp-2226	DyPd	2	221	Cubic	binary_easy
mp-1121	GaCo	2	221	Cubic	binary_easy
mp-2735	PaO	2	225	Cubic	binary_easy
mp-1169	ScCu	2	221	Cubic	binary_easy
mp-30746	YIr	2	221	Cubic	binary_easy
mp-24658	SmH2	3	225	Cubic	binary_easy
mp-20225	CePb3	4	221	Cubic	binary_easy
mp-788	Co2Te2	4	194	Hexagonal	binary_easy
mp-20176	DyPb3	4	221	Cubic	binary_easy
mp-1231	Cr6Ga2	8	223	Cubic	binary_easy
mp-12570	ThB12	13	225	Cubic	binary_easy
mp-13452	BePd2	3	139	Tetragonal	binary_hard
mp-11359	Ga2Cu	3	123	Tetragonal	binary_hard
mp-1995	PrC2	3	139	Tetragonal	binary_hard
mp-30501	Ti2Cd	3	139	Tetragonal	binary_hard
mp-30789	U2Mo	3	139	Tetragonal	binary_hard
mp-454	NaGa4	5	139	Tetragonal	binary_hard
mp-1827	SrGa4	5	139	Tetragonal	binary_hard
mp-2129	Nd2Ge4	6	141	Tetragonal	binary_hard
mp-30682	ZrGa	8	141	Tetragonal	binary_hard
mp-2128	Sn8Pd2	10	68	Orthorhombic	binary_hard
mp-1208467	Tb8Al2	10	227	Cubic	binary_hard
mp-640079	Mn9Au3	12	123	Tetragonal	binary_hard
mp-20132	InHg	2	166	Trigonal	binary_medium
mp-2209	CeGa2	3	191	Hexagonal	binary_medium
mp-30497	TbCd2	3	191	Hexagonal	binary_medium
mp-30725	YHg2	3	191	Hexagonal	binary_medium
mp-2731	TiGa3	4	139	Tetragonal	binary_medium
mp-2510	ZrHg	4	123	Tetragonal	binary_medium
mp-2740	ErCo5	6	191	Hexagonal	binary_medium
mp-570875	Ga4Os2	6	70	Orthorhombic	binary_medium
mp-861	Hf4Ni2	6	140	Tetragonal	binary_medium
mp-1566	SmFe5	6	191	Hexagonal	binary_medium
mp-2387	Th4Zn2	6	140	Tetragonal	binary_medium
mp-1607	YbCu5	6	191	Hexagonal	binary_medium
mp-8882	Ga2P2	4	186	Hexagonal	polymorph_binary
mp-13181	LaF3	4	225	Cubic	polymorph_binary
mp-568382	Mn2Bi2	4	194	Hexagonal	polymorph_binary
mp-1004	Nb3Si	4	225	Cubic	polymorph_binary
mp-2067	Th2Ga4	6	141	Tetragonal	polymorph_binary
mp-2178	Yb2Ga4	6

AI搜集汇总

数据集介绍

构建方式

CSPBENCH数据集通过精心挑选的180个晶体结构构建而成，这些结构来自Materials Project数据库，涵盖了二元、三元和四元化合物，确保了多样性和代表性。数据集的构建过程中，考虑了晶体系统的对称性、原子比例、空间群以及单胞的形状和尺寸等因素，以确保测试集能够全面评估晶体结构预测算法的性能。

特点

CSPBENCH数据集的显著特点在于其广泛的多样性和复杂性，涵盖了从简单到复杂的多种晶体结构。数据集中包含了不同空间群和晶体系统的结构，确保了测试集的全面性。此外，数据集还特别关注了多态性结构，即同一化学成分可能存在多种晶体结构，这为评估算法的鲁棒性和准确性提供了挑战。

使用方法

CSPBENCH数据集可用于评估和比较多种晶体结构预测算法，包括基于模板的方法、机器学习方法和密度泛函理论（DFT）方法。使用者可以通过计算预测结构与真实结构之间的距离指标（如M3GNet能量距离、Chamfer距离等）来评估算法的性能。此外，数据集还提供了详细的评估指标和排名系统，帮助研究者更好地理解不同算法的优缺点，并为未来的算法改进提供参考。

背景与挑战

背景概述

晶体结构预测（Crystal Structure Prediction, CSP）在材料科学中具有重要意义，尤其是在发现具有广泛工业应用的新材料方面。然而，尽管该领域已有数十年的发展，但缺乏一套完善的基准数据集、定量性能评估指标以及对当前技术状态的系统评估。CSPBENCH数据集由南卡罗来纳大学、江苏师范大学、芝加哥大学等机构的研究人员共同开发，旨在填补这一空白。该数据集包含了180个经过精心挑选的晶体结构，涵盖二元、三元和四元化合物，旨在为CSP算法提供一个全面的基准测试平台。CSPBENCH不仅提供了13种最先进的CSP算法的性能评估，还引入了新的性能度量标准，以量化算法的准确性、效率和可靠性。

当前挑战

CSPBENCH数据集的构建和应用面临多重挑战。首先，晶体结构预测的核心问题在于如何准确预测复杂化合物的晶体结构，尤其是在缺乏实验数据的情况下。其次，构建过程中需要考虑晶体结构的多样性，包括不同的空间群、晶系以及原子数目，以确保数据集的广泛代表性。此外，CSP算法的性能评估需要克服晶体结构的多态性问题，即同一化学成分可能存在多种晶体结构。最后，CSP算法的性能不仅依赖于机器学习势函数的质量，还取决于全局优化算法的能力，这使得算法的性能评估更加复杂。

常用场景

经典使用场景

CSPBENCH数据集的经典使用场景在于评估和比较多种晶体结构预测（CSP）算法。该数据集包含了180个精心挑选的晶体结构，涵盖了二元、三元和四元化合物，具有不同的空间群和晶系。通过使用CSPBENCH，研究者可以对现有的CSP算法进行基准测试，评估其在不同复杂度结构上的预测性能，从而为材料发现提供有力的工具。

实际应用

CSPBENCH数据集在实际应用中具有广泛的前景，特别是在材料科学和工业领域。通过该数据集，研究者可以快速筛选和预测具有特定物理、化学或机械性能的新材料。例如，在电池材料、催化剂和半导体等领域，CSPBENCH可以帮助研究人员快速找到具有潜在应用价值的晶体结构，从而加速新材料的开发和商业化进程。

衍生相关工作

CSPBENCH数据集的发布催生了一系列相关的经典工作。例如，基于该数据集的研究揭示了模板驱动和机器学习势能驱动的CSP算法在不同复杂度结构上的表现差异。此外，CSPBENCH还推动了图神经网络（GNN）和深度学习在晶体结构预测中的应用，进一步提升了算法的预测精度和效率。这些衍生工作不仅丰富了CSP领域的研究内容，还为未来的材料发现提供了新的思路和方法。