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Gene database of Pseudomonas protegens Pf-5

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DataCite Commons2025-06-01 更新2024-07-27 收录
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<i>Pseudomonas protegens</i> Pf-5 is an important biocontrol bacterium present in multitude of environmental surfaces. A Gram-negative bacterium with a versatile metabolism, <i>P. protegens</i> Pf-5 is emerging as an important biotechnology workhorse, particularly in the area of recovering useful metals from metal ores or electron scrap materials. Herein, the annotated genome sequence of <i>P. protegens</i> Pf-5 (NCBI Reference Sequence: NC_004129.6) was parsed by an in-house MATLAB algorithm to yield a gene database comprising all gene names and their associated gene function and gene sequence. The database should find use in a variety of metabolic engineering and biotechnology applications seeking to demonstrate novel use of the bacterium in environmental remediation and crop protection through recombinant DNA technology.<br><br>

产素假单胞菌 Pf-5(Pseudomonas protegens)是一类重要的生防细菌,广泛存在于多种环境表面。作为一种代谢多功能的革兰氏阴性菌,该菌株正逐渐成为重要的生物技术工具菌,尤其在从金属矿石或电子废料中回收有价金属领域具有重要应用前景。 本文通过自研MATLAB算法解析了产素假单胞菌 Pf-5 的注释基因组序列(NCBI参考序列:NC_004129.6),构建了涵盖所有基因名称、对应基因功能及基因序列的基因数据库。该数据库可应用于各类代谢工程与生物技术研究,旨在通过重组DNA技术,开发该菌株在环境修复及作物保护领域的新型应用价值。
提供机构:
figshare
创建时间:
2019-12-03
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数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
该数据集包含_Pseudomonas protegens_ Pf-5细菌的基因数据库,涵盖所有基因名称、功能及序列,适用于代谢工程和生物技术应用,特别是在环境修复和作物保护领域。数据集基于NCBI参考序列NC_004129.6,通过MATLAB算法解析生成,采用CC BY 4.0许可。
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