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Synergy

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Hugging Face2025-05-18 更新2025-05-19 收录
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https://huggingface.co/datasets/ai-chem/Synergy
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资源简介:
该数据集包含多个特征,如序列号、纳米粒子合成、细菌种类、菌株、药物、药物剂量、纳米粒子浓度、纳米粒子大小、形状、方法、ZOI(抑制圈大小或最小抑制浓度)、ZOI误差、抗菌活性倍增、zeta电位、MDR(多重耐药)、FIC(分数抑制浓度)、效果、参考文献、DOI、文章列表、时间、抗菌肽聚合物涂层、联合MIC(最小抑制浓度)、肽MIC、存活率及其误差、期刊名称、出版商、年份、标题、期刊是否开放获取、是否开放获取、开放获取状态、PDF链接、访问次数等。数据集分为训练集,包含3232个示例,总大小为2069124字节。该数据集的许可为MIT。
创建时间:
2025-05-12
搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
在纳米医学与微生物学交叉领域,Synergy数据集通过系统整合来自多篇科学文献的实验数据构建而成。该过程涉及从权威期刊中提取纳米颗粒与抗生素协同抗菌作用的关键参数,包括药物剂量、纳米颗粒浓度、尺寸分布及抑菌圈测量值等结构化特征。数据采集严格遵循文献中的实验记录,并利用标准化字段实现跨研究数据的统一表征,最终形成涵盖三千余条样本的规范化集合。
特点
该数据集的核心价值在于其多维度的协同作用表征体系,不仅囊括了纳米颗粒的物理化学属性如粒径、电位和形貌,还精确记录了药物与纳米材料联合作用时的抑菌效能指标。特征字段设计兼顾了微生物菌株类型、耐药性标记及剂量响应曲线等关键变量,通过折叠活性增强系数和分级抑制浓度等量化指标,清晰呈现了协同效应的强度与趋势。
使用方法
研究者可通过加载数据集直接访问训练分割中的三千余条样本,每条数据包含完整的协同作用实验参数。典型应用流程包括基于纳米颗粒特性预测抗菌增效效果,或通过药物-纳米颗粒组合的剂量响应关系构建机器学习模型。数据集中提供的文献DOI与原始论文链接,为深度验证实验设计和机制分析提供了溯源支持。
背景与挑战
背景概述
随着抗生素耐药性问题的日益严峻,纳米颗粒与抗生素协同抗菌研究成为生物医学领域的前沿方向。Synergy数据集由AI-Chem研究团队构建,聚焦于纳米颗粒与药物联合作用对抗多重耐药菌的机制探索。该数据集系统整合了纳米颗粒合成参数、药物剂量效应及细菌抑制效果等多维度实验数据,为开发新型抗菌策略提供了关键数据支撑,显著推动了计算化学与药物发现领域的交叉研究进展。
当前挑战
在抗菌协同效应研究领域,量化纳米颗粒与抗生素的相互作用强度及其对耐药菌的抑制效果存在显著复杂性。数据集构建过程中需克服实验参数标准化难题,包括纳米颗粒尺寸分布测量的一致性、不同菌株对药物响应差异的归一化处理,以及跨文献数据中抑制区直径与最小抑菌浓度指标的整合挑战。此外,异构数据源中时间单位、浓度计量方式的统一亦构成重要技术瓶颈。
常用场景
经典使用场景
在纳米医学与微生物学交叉领域,Synergy数据集通过系统记录纳米颗粒与抗生素的协同抗菌效应,为研究复合抗菌策略提供了标准化实验数据。该数据集常被用于构建机器学习模型,预测不同纳米材料与药物组合对多重耐药菌的抑制效果,显著提升了抗菌方案筛选的效率和准确性。
实际应用
在临床与制药领域,Synergy数据集指导开发新型纳米抗菌制剂,通过优化纳米颗粒的尺寸、形貌及表面修饰参数,增强传统抗生素对耐药菌株的穿透性。其数据支撑了智能给药系统的设计,在伤口感染治疗和医疗器械涂层等场景中展现出转化潜力。
衍生相关工作
基于该数据集衍生的经典研究包括纳米颗粒-药物协同效应预测算法开发,以及多模态抗菌活性图谱构建。这些工作进一步催生了跨尺度抗菌模型库和开放式计算平台,为纳米生物界面研究提供了可扩展的分析框架。
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