S-LDSC reference files

#8/28/2023: New version includes the file hm3_no_MHC.list Files required to partition heritability with S-LDSC. Reference, baseline and baseline-LD files for EUR populations: 1000G_Phase3_baseline_v1.2_ldscores.tgz 1000G_Phase3_baselineLD_v2.2_ldscores.tgz 1000G_Phase3_baselineLD_v2.3_ldscores.tgz 1000G_Phase3_frq.tgz 1000G_Phase3_ldscores.tgz 1000G_Phase3_plinkfiles.tgz 1000G_Phase3_weights_hm3_no_MHC.tgz baselineLD_v2.2_bedfiles.tgz GRCh38.tgz readme_baseline_versions Sumstats files for EUR populations: sumstats.tgz Reference, baseline and baseline-LD files for EAS populations: 1000G_Phase3_EAS_baseline_v1.2_ldscores.tgz 1000G_Phase3_EAS_baselineLD_v2.2_ldscores.tgz 1000G_Phase3_EAS_plinkfiles.tgz 1000G_Phase3_EAS_weights_hm3_no_MHC.tgz List of HapMap3 SNPs outputed when computing LD scores: hm3_no_MHC.list# 2023年8月28日：新版本新增hm3_no_MHC.list文件。 用于通过分层连锁不平衡得分回归（S-LDSC）开展遗传力分区的所需文件。 欧洲（EUR）人群参考、基线及基线-LD文件： 1000G_Phase3_baseline_v1.2_ldscores.tgz 1000G_Phase3_baselineLD_v2.2_ldscores.tgz 1000G_Phase3_baselineLD_v2.3_ldscores.tgz 1000G_Phase3_frq.tgz 1000G_Phase3_ldscores.tgz 1000G_Phase3_plinkfiles.tgz 1000G_Phase3_weights_hm3_no_MHC.tgz baselineLD_v2.2_bedfiles.tgz GRCh38.tgz readme_baseline_versions 欧洲（EUR）人群汇总统计文件：sumstats.tgz 东亚（EAS）人群参考、基线及基线-LD文件： 1000G_Phase3_EAS_baseline_v1.2_ldscores.tgz 1000G_Phase3_EAS_baselineLD_v2.2_ldscores.tgz 1000G_Phase3_EAS_plinkfiles.tgz 1000G_Phase3_EAS_weights_hm3_no_MHC.tgz 计算连锁不平衡得分时输出的HapMap3 单核苷酸多态性位点列表：hm3_no_MHC.list

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集为S-LDSC（一种遗传学分析方法）提供参考文件，主要用于遗传力分区研究，包含针对欧洲和东亚人群的基因组参考、基线和LD评分文件，以及HapMap3 SNP列表。数据集更新至2023年，包含多个版本和大型文件（总大小约9.3 GB），适用于群体遗传学和生物信息学分析。