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通过单细胞染色质可及性鉴定驱动小鼠脊髓发育过程中驱动基因表达的增强子调控网络

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干细胞与再生医学数据中心2023-07-03 更新2024-03-06 收录
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http://data.iscr.ac.cn/Article?id=649f8268222f0139804a90be
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本课题系统绘制了小鼠脊髓发育过程中的单细胞染色质开放性图谱,并利用自主开发的增强子调控网络eNet算法,鉴定出影响脊髓神经细胞发育的关键调控因子及其增强子调控网络。最后,以dp1/dIl细胞重要调控因子Atoh1基因的增强子调控网络为例,利用增强子报告基因转基因小鼠和增强子敲除小鼠,在体内验证了该增强子网络对Atoh1基因表达的影响。在研究过程中,通过干湿实验相结合的方法解析了增强子调控网络,并在体内进行了验。科学数据获取全面规范。
提供机构:
中国科学院遗传与发育生物学研究所
创建时间:
2023-07-03
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