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scikit-fingerprints/MoleculeNet_BBBP|化学数据集|生物医学数据集

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hugging_face2024-07-18 更新2024-07-22 收录
化学
生物医学
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https://hf-mirror.com/datasets/scikit-fingerprints/MoleculeNet_BBBP
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资源简介:
MoleculeNet BBBP数据集是MoleculeNet基准测试的一部分,专注于预测小分子药物穿透血脑屏障的能力。数据集包含2039个样本,任务类型为分类,推荐的评估指标是AUROC。该数据集适用于化学、生物学和医学领域的研究,并且推荐使用scikit-fingerprints库进行处理。

The BBBP (Blood-Brain Barrier Penetration) dataset is part of the MoleculeNet benchmark, designed to predict the blood-brain barrier penetration of small drug-like molecules. It contains 2039 samples, recommends scaffold splitting, and uses AUROC as the evaluation metric. The dataset is relevant to chemistry, biology, and medical fields, and is applicable to tabular classification, graph machine learning, and text classification tasks.
提供机构:
scikit-fingerprints
原始信息汇总

MoleculeNet BBBP 数据集概述

基本信息

  • 数据集名称: MoleculeNet BBBP
  • 任务类别:
    • 表格分类
    • 图机器学习
    • 文本分类
  • 标签:
    • 化学
    • 生物学
    • 医学
  • 数据集规模: 1K<n<10K

数据集配置

  • 配置名称: default
  • 数据文件:
    • 分割: train
    • 路径: bbbp.csv

任务描述

  • 任务: 预测小分子药物的血脑屏障渗透性(屏障渗透性)
  • 任务类型: 分类
  • 总样本数: 2039
  • 推荐分割: scaffold
  • 推荐评估指标: AUROC

参考文献

  • 文献1: Ines Filipa Martins et al. "A Bayesian Approach to in Silico Blood-Brain Barrier Penetration Modeling" J. Chem. Inf. Model. 2012, 52, 6, 1686–1697
  • 文献2: Wu, Zhenqin, et al. "MoleculeNet: a benchmark for molecular machine learning." Chemical Science 9.2 (2018): 513-530
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