线虫蛋白质PUF-8对mRNA 3’UTR的结构识别对寿命的限制的分子机制

本数据集来自于线虫蛋白质PUF-8对mRNA3’UTR的结构识别对寿命的限制的分子机制这一方向。PUF-8是线虫中一个经典的RNA结合蛋白质，是调控线虫性腺生殖干细胞发育分化以及精卵细胞转换过程中的重要调控蛋白质。最近的研究也提示了PUF-8在寿命调控中具有的潜在作用。PUF-8蛋白质具有一个经典的PUF （Pumilio and FBF） 结构域，该结构域由8个PUF repeat组成，每个repeat由三个α螺旋构成。一般来说，每一个PUF repeat能够结合一个RNA碱基，形成拉链型的配对模式。课题组测定了带有RNA底物的PUF-8的PUM结构域与RNA复合物的晶体结构，本数据集包含了解析结构时收集的晶体衍射数据原始文件（cbr文件）。在结构解析的基础上，通过定点突变实验改变PUF-8对其靶mRNA的识别（ITC结果总结为PDF文件）。通过总mRNA深度测序、体内RNA交联和免疫共沉淀实验，确定了6个PUF-8调控的基因，它们在3’UTR至少包含有一个PUF结合原件（PBE）（DOC文件和TIFF文件）。发现其中一个基因pqm-1对脂质储存和衰老过程至关重要，基因敲除后可以逆转因puf-8突变线虫寿命的延长。该数据集为2019YFA0508403-011，内容为线虫蛋白质PUF-8对mRNA3’UTR识别的结构机制，包括1个晶体衍射数据文件夹，1个ITC原始数据文件夹，一个mRNA深度测序文件夹和1个已发表文章（Structural recognition of the mRNA 3UTR by PUF-8 restricts the lifespan of C. elegans.pdf）。