Bologna Annotation Resource

BAR 3.0 is a server for the annotation of protein sequences relying on a comparative large-scale analysis on the entire UniProt. With BAR 3.0 and a sequence you can annotate when possible: function (Gene Ontology), structure (Protein Data Bank), protein domains (Pfam). Also if your sequence falls into a cluster with a structural/some structural template/s we provide an alignment towards the template/templates based on the Cluster-HMM (HMM profile) that allows you to directly compute your 3D model. Cluster HMMs are available for downloading.

BAR 3.0是一款蛋白质序列注释服务器，其依托于针对全量UniProt（通用蛋白质资源库，Universal Protein Resource）的大规模比较分析。借助BAR 3.0及目标蛋白质序列，用户可在可行范围内完成三类注释：功能注释（基于基因本体（Gene Ontology））、结构注释（基于蛋白质数据银行（Protein Data Bank））以及蛋白质结构域注释（基于Pfam）。此外，若待分析序列归入包含一个或多个结构模板的聚类中，我们将基于聚类隐马尔可夫模型（Cluster-HMM，即隐马尔可夫模型（HMM）特征谱）提供针对该等模板的序列比对，借此可直接计算得到目标序列的三维结构模型。聚类隐马尔可夫模型文件可供下载。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

BAR 3.0是一个蛋白质序列注释服务器，基于UniProt全库比较分析，可对蛋白质功能、结构和结构域进行注释。它还支持通过Cluster-HMM生成3D模型，并提供相关模板下载。