转录组分析显示，在不同种植密度下，杨树（Populus×euramericana）中存在不同的基因表达模式。
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-10-27 更新2024-03-06 收录
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资源简介：
某些植物基因型在适当的环境条件下可以达到最佳的生长。在高种植密度条件下，植物面临着对光和养分的吸收和利用的竞争。然而，多年生木本植物的全基因组表达模式与种植密度之间的关系尚不清楚。本研究在三种不同的采样高度下对欧美杨进行全基因组RNA测序，以确定高(HD)和低(LD)栽培密度下的基因表达模式。结果表明，在HD和LD之间检测到4004个差异表达基因(DEGs)，其中在上、中、下三个位置分别检测到2300、701和1003个。功能注释结果进一步表明，大量的DEG参与了不同的生物学功能。代谢相关基因对种植密度的影响和刺激相关基因的表达有显著变化。在所有三个位置都发现了37个DEG，随后进行了筛选。在不同的位置观察到几种与植物光响应和光合作用相关的DEG。同时，生长素醇醇-3-乙酸和碳氮代谢相关基因数量也显示，HD下总体呈上调趋势。这些发现为鉴定与栽培密度相关的候选基因提供了基础，并有助于提高我们对种植密度对基因表达影响的分子理解。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2022-10-27
