SaltKG耐盐碱基因知识图谱数据

本数据主要用于植物耐盐碱相关基因的检索、证据整合与候选基因分析，适用对象为从事植物抗逆遗传改良、分子育种与基因功能研究的科研人员，适用范围为已在公开文献与公共数据库中报道的耐盐碱相关基因及其证据体系。 具体应用场景：（1）植物耐盐碱相关基因检索：科研人员按基因名称、物种、耐盐碱机制分级或基因家族条件检索，可在同一界面获得标准化的基因标识、别名、功能效应、表达响应与核心验证方法，解决候选基因线索分散在不同数据库、需反复人工比对的问题。 （2）文献证据追溯：依据 PMID、题名、摘要、基因—文献关联以及文献所附图表图像，可直接定位某一基因功能结论的原始实验依据与图表证据，解决结论与证据脱节、难以快速核验的问题。 （3）基因调控网络分析：通过条件网络、以基因为中心的邻域网络和批量网络接口，查询激活、抑制、互作、调控关系，识别枢纽基因与关联通路，解决单基因视角难以判断其在耐盐碱调控网络中作用位置的问题。 （4）同源基因比较与序列获取：获取跨物种同源基因及其相似度、覆盖度指标，并获取 CDS、蛋白、UTR 与启动子序列，支撑将模式植物的功能结论迁移到作物，解决跨物种功能推断缺乏统一比对依据的问题。 （5）表达响应分析与候选基因功能验证辅助：汇总公开表达研究中的 TPM 表达量、差异表达倍数与显著性统计及研究元数据，判断基因是否为盐响应基因，为候选基因筛选、引物设计与后续过表达、敲除等功能验证实验提供数据依据。