SVTopo manuscript source code and images

NIAID Data Ecosystem2026-05-02 收录

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This tarball "SVTopo-Material.tar.gz" contains source code for SVTopo v0.2.0, with an example web page containing complex structural variant images for 7 genomes. The top 3 levels of of the tarball file tree, except PNG image files, are as follows: SVTopo-Materials/ ├── HiFi-SVTopo-0.2.0 │ ├── Cargo.lock │ ├── Cargo.toml │ ├── LICENSE-THIRDPARTY.json │ ├── LICENSE.md │ ├── SVTopoVz │ │ ├── MANIFEST.in │ │ ├── requirements.txt │ │ ├── setup.cfg │ │ ├── setup.py │ │ └── svtopovz │ ├── docs │ │ ├── imgs │ │ ├── result_interpretation.md │ │ └── user_guide.md │ ├── readme.md │ ├── src │ │ ├── bam_sa_parser.rs │ │ ├── block_filter.rs │ │ ├── cli.rs │ │ ├── cluster_connector.rs │ │ ├── cluster_finder.rs │ │ ├── containers.rs │ │ ├── event_graph_builder.rs │ │ ├── graph_annotator.rs │ │ ├── ingester.rs │ │ ├── main.rs │ │ ├── result_writer.rs │ │ └── utils.rs │ └── test │ ├── data │ ├── scripts │ └── unit_test └── example_site ├── docs │ ├── 200080.bed.gz │ ├── 200080.json.gz │ ├── 200100.bed.gz │ ├── 200100.json.gz │ ├── HG002.bed.gz │ ├── HG002.json.gz │ ├── NA12889.bed.gz │ ├── NA12889.json.gz │ ├── NA12890.bed.gz │ ├── NA12890.json.gz │ ├── NA12891.bed.gz │ ├── NA12891.json.gz │ ├── NA12892.bed.gz │ ├── NA12892.json.gz │ ├── imgs │ ├── index.html └── readme.md

创建时间：

2025-03-26

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