Transcriptional profiling of cortex from a mouse model of Huntington's disease (Q140) crossed with Ccdc82 heterozygous and homozygous mice [Ccdc82]

Cortex was isolated from 6-month-old Ccdc82+/- and Ccdc82-/- mice crossed with the Q140 knock-in (KI) HD mice and their respective controls. Transcriptomic analysis (RNASeq) was performed on 6 genotypes: WT, Q140, Ccdc82+/-, Q140 X Ccdc82+/-, Ccdc82-/-, and Q140 X Ccdc82-/-, 7-8 replicates per genotype. RNASeq analysis was performed on samples from the cortex tissues of 6-month-old wild type, Q140, Ccdc82+/-, Q140 X Ccdc82+/-, Ccdc82-/-, and Q140 X Ccdc82-/- mice. N = 7-8 per group.本研究将Ccdc82杂合敲除（Ccdc82+/-）、纯合敲除（Ccdc82-/-）小鼠与Q140敲入（knock-in, KI）亨廷顿舞蹈病（HD）模型小鼠及其各自的野生型对照进行杂交，从所得6月龄子代小鼠中分离皮层组织。随后针对6种基因型的皮层样本开展转录组测序（RNASeq）分析，涵盖的基因型分别为野生型（WT）、Q140、Ccdc82+/-、Q140 × Ccdc82+/-、Ccdc82-/-以及Q140 × Ccdc82-/-，每组设置7~8个生物学重复。本次实验的所有样本均取自上述6种基因型6月龄小鼠的皮层组织，每组样本量N=7~8。