五个Laburnicola rhizohalophila菌株Pacbio及HI-C挂载结果
收藏国家林业和草原科学数据中心2024-06-14 更新2024-07-22 收录
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资源简介：
采用PacBio Sequel II和Novogene(中国天津)的循环共识测序(CCS)模式进行高通量基因组测序。我们构建了一个SMRTbell文库，并在CCS模式下采用高保真(HiFi)读取的PacBio Sequel II测序。使用hifiasm v0.15.4-r342使用默认参数设置组装PacBio HiFi配置。随后，为了建Hi-C文库，采集了L. rhizohalophila的新鲜菌丝，并进行甲醛固定、交联、酶切、填充末端、生物素标记、环化、纯化和DNA剪切。采用高通量测序技术对末端测序，对标记的靶DNA片段进行捕获和测序。获得的数据经过质量控制和过滤，然后与hifiasm组装的组块对齐。对于染色体的基因组锚定，我们使用3D-DNA来辅助聚类、分类和定位基因组序列。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2024-06-14
