Dataset of chemical-induced gene signatures (CIGS)

These tables provide detailed information on 11,356 MCE bioactive compounds and 1,865 TCM compounds, including their names, treatment concentrations, and the cell lines used. Additionally, they include gene expression profiles resulting from the perturbation of MDA-MB-231 and HEK293T cells by 13,221 compounds.

本数据集所附表格详细收录了11356种MCE生物活性化合物与1865种TCM（Traditional Chinese Medicine）化合物的相关信息，涵盖化合物名称、作用浓度及所用细胞系等内容。此外，表格还包含了13221种化合物分别对MDA-MB-231与HEK293T细胞进行扰动处理后所产生的基因表达谱数据。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是一个化学诱导基因签名（CIGS）资源，专注于高通量药物筛选研究。它整合了13,221种化合物（包括11,356种MCE生物活性化合物和1,865种TCM化合物）对MDA-MB-231和HEK293T细胞系的扰动数据，提供了详细的基因表达谱、化合物名称、处理浓度和细胞系信息。数据集通过HiMAP-seq技术生成，适用于基因表达特征分析和药物发现应用。