RepEnTools - mm39 RMSK.gtf

mm39 RMSK.gtf for RepEnToolsOnly suitable for mm39Original bed12 file made with repeat masker (www.repeatmasker.org), downloaded from UCSC Table Browser (Karolchik, 2004). Last updated:<b> </b>2020-07-30The repeat masker (RMSK) annotation file employed<b> </b>in <i>RepEnTools</i> is adjusted to correctly represent the information on the repeat element.

适用于RepEnTools的mm39版本重复掩码器（RepeatMasker）注释GTF文件（mm39 RMSK.gtf），仅兼容mm39基因组版本。该文件的原始bed12格式版本由重复掩码器（RepeatMasker，www.repeatmasker.org）生成，下载自UCSC表格浏览器（UCSC Table Browser，Karolchik等，2004）。最后更新日期：2020年7月30日。RepEnTools所采用的重复掩码器（RMSK）注释文件已进行优化调整，可准确呈现重复元件的相关信息。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集提供mm39基因组的repeat masker注释文件，适用于RepEnTools进行重复元素分析。文件来源于UCSC Table Browser，最后更新于2020年7月30日，采用CC BY 4.0许可。