scPlantDB

scPlantDB is a comprehensive database for plant single-cell transcriptomic profiles, integrating data from 67 high-quality datasets across 17 plant species, comprising approximately 2.5 million cells. The database offers interactive visualization of gene expression at the single-cell level and enables systematic comparison and functional annotation of markers across diverse cell types and species.

scPlantDB是一款面向植物单细胞转录组谱的综合性数据库，整合了覆盖17种植物的67个高质量数据集，总计包含约250万个细胞。该数据库支持单细胞水平基因表达的交互式可视化，并可实现不同细胞类型与物种间标记基因的系统性比较及功能注释。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

scPlantDB是一个专门针对植物单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的综合数据库，旨在解决植物领域缺乏此类资源的问题。它覆盖17个植物物种，包括67个数据集、367个实验、超过250万个细胞、259个细胞类型和近23万个细胞标记，并提供多种搜索和分析工具，如基于标记基因、细胞类型和序列的查询功能。