Transcriptional profiling of striatum from a mouse model of Huntington's disease (Q140) crossed with Ccdc82 heterozygous and homozygous mice [Ccdc82]

Striatum was isolated from 6-month-old Ccdc82+/- and Ccdc82-/- mice crossed with the Q140 knock-in (KI) HD mice and their respective controls. Transcriptomic analysis (RNASeq) was performed on 6 genotypes: WT, Q140, Ccdc82+/-, Q140 X Ccdc82+/-, Ccdc82-/-, and Q140 X Ccdc82-/-, 7-8 replicates per genotype. RNASeq analysis was performed on samples from the striatum tissues of 6-month-old wild type, Q140, Ccdc82+/-, Q140 X Ccdc82+/-, Ccdc82-/-, and Q140 X Ccdc82-/- mice. N = 7-8 per group.本研究从与Q140敲入（KI）亨廷顿舞蹈症（HD）小鼠及其对应野生型对照交配获得的6月龄Ccdc82杂合子（Ccdc82+/-）与Ccdc82纯合子敲除（Ccdc82-/-）小鼠体内分离纹状体组织。针对6种基因型的小鼠纹状体样本开展转录组分析（RNA测序，RNASeq），涉及的基因型分别为野生型（WT）、Q140、Ccdc82+/-、Q140 × Ccdc82+/-、Ccdc82-/-以及Q140 × Ccdc82-/-，每组设置7~8个生物学重复。