FishExp

Here, we present FishExp, a web-based data platform covering gene expression and alternative splicing in 26,081 RNA-seq experiments from 44 fishes. It allows users to query the data in a variety of ways, including gene identifier/symbol, functional term, and BLAST alignment. Moreover, users can customize experiments and tools to perform differential/specific expression and alternative splicing analysis, co-expression and cross-species analysis. In addition, functional enrichment is provided to confer biological significance.在此，我们推出FishExp平台——一款基于网页的数据平台，涵盖了来自44种鱼类的26081个RNA测序（RNA-seq）实验中的基因表达与可变剪接数据。该平台支持用户通过多种方式查询数据，包括基因标识符/基因符号、功能术语以及BLAST比对。此外，用户可自定义实验组合与分析工具，开展差异表达/特异性表达分析、可变剪接分析、共表达分析以及跨物种分析。除此之外，平台还提供功能富集分析服务，以帮助研究者解析分析结果的生物学意义。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

FishExp是一个基于网络的数据平台，整合了44种鱼类共26,081个RNA-seq实验的基因表达和可变剪接数据。该平台支持通过基因标识符、功能术语或BLAST比对进行查询，并提供差异表达、共表达及跨物种分析等定制化工具。