PlantPAN

PlantPAN 4.0 is an integrative resource for constructing transcriptional regulatory networks for diverse plant species. In this release, the gene annotation and promoter sequences were expanded to cover 115 species. PlantPAN 4.0 can help users characterize the evolutionary differences and similarities among cis-regulatory elements; furthermore, this system can now help in identification of conserved non-coding sequences among homologous genes.PlantPAN 4.0是一款用于构建多种植物物种转录调控网络的整合型资源。在此版本中，基因注释与启动子序列的覆盖范围已扩展至115个植物物种。PlantPAN 4.0可帮助用户阐释顺式调控元件（cis-regulatory elements）之间的进化差异与相似性；此外，该系统现已可用于鉴定同源基因间的保守非编码序列（conserved non-coding sequences）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

PlantPAN 4.0是一个综合性资源，用于构建多种植物物种的转录调控网络，提供非冗余的3428个植物转录因子矩阵以支持TFBS预测，并覆盖115个物种的启动子序列。该系统能够帮助用户检测转录因子结合位点、分析启动子，并识别同源基因间的保守非编码序列，从而促进进化差异和相似性的研究。