Ocean Read Atlas

Ocean Read Atlas (ORA) is a web service to explore the biogeography of one or several sequences in a marine environmental context. ORA enables to query DNA sequences against an index of read sequences and determine the similarity to each indexed sample.

海洋读取图谱（Ocean Read Atlas，ORA）是一款可在海洋环境背景下探究单条或多条序列生物地理分布的Web服务。ORA可针对读取序列索引库查询DNA序列，并判定其与各索引样本的相似性。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Ocean Read Atlas是一个网络服务，用于分析DNA序列在海洋环境中的生物地理分布。它基于Tara Oceans数据集，通过k-mer共享比对，在海洋地图上可视化序列分布，并关联温度、氧气等环境特征进行分析。