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miRVim is a comprehensive database providing predicted secondary (13,971) and tertiary (17,045) structures for human microRNAs (miRNAs), supplementing limited experimentally determined structures. It integrates predictions from multiple algorithms (MXFold2, CentroidFold, RNAFold, RNAComposer, 3dRNA) and available PDB structures, serving as a vital resource for computational drug discovery (e.g., virtual screening, ML/AI) targeting miRNAs.

miRVim是一款综合性数据库,可为人类微小核糖核酸(microRNA,miRNA)提供预测得到的二级结构(共计13,971条)与三级结构(共计17,045条),弥补了实验测定的微小核糖核酸结构数量有限的短板。该数据库整合了MXFold2、CentroidFold、RNAFold、RNAComposer、3dRNA等多种算法的预测结果,以及现有蛋白质数据库(Protein Data Bank,PDB)中的结构数据,可作为针对微小核糖核酸的计算药物发现研究(如虚拟筛选、机器学习/人工智能相关研究)的重要资源。

搜集汇总
数据集介绍
miRVim 数据集图片
背景与挑战
背景概述
miRVim是一个综合性的人类miRNA结构数据库,提供了13,971个预测的二级结构和17,045个预测的三维结构,覆盖1,926个人类miRNA。它整合了多种预测算法和实验结构,旨在弥补实验数据的不足,为基于虚拟筛选、机器学习和人工智能的miRNA靶向药物发现提供关键资源。
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