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RPG

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知名数据库2026-06-11 收录
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http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/
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资源简介:
RPG is a new database that provides detailed information about ribosomal protein (RP) genes. It contains data from humans and other organisms, including Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans, Saccharo myces cerevisiae, Methanococcus jannaschii and Escherichia coli. Users can search the database by gene name and organism. Each record includes sequences (genomic, cDNA and amino acid sequences), intron/exon structures, genomic locations and information about orthologs. In addition, users can view and compare the gene structures of the above organisms and make multiple amino acid sequence alignments. RPG also provides information on small nucleolar RNAs (snoRNAs) that are encoded in the introns of RP genes.

RPG是一款新型数据库,可为核糖体蛋白(ribosomal protein,简称RP)基因提供详实的信息。该数据库涵盖人类及其他多个物种的数据,包括黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、詹氏甲烷球菌(Methanococcus jannaschii)以及大肠杆菌(Escherichia coli)。用户可通过基因名称及物种来源对该数据库进行检索,每条记录均包含序列信息(基因组序列、cDNA序列与氨基酸序列)、内含子/外显子结构、基因组定位以及直系同源基因相关信息。此外,用户可查看并比对上述物种的基因结构,还可开展多氨基酸序列比对分析。RPG数据库还提供了一类由RP基因内含子编码的核仁小RNA(small nucleolar RNAs,简称snoRNAs)的相关信息。
提供机构:
Miyazaki University
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
RPG是一个专注于核糖体蛋白基因的数据库,涵盖从人类到多种真核生物、古菌和细菌的广泛物种。它提供基因序列、结构、位置和同源信息,并支持搜索、比较和序列比对功能,同时包含相关核仁小RNA数据。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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