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金黄色葡萄球菌 （S. aureus） 可 导致人类和动物的各种感染，从而导致高发病率和死亡率。 的跨物种传播金黄色葡萄球菌，有必要了解与宿主相关的遗传变异。 我们进行了一项两阶段的全基因组关联研究 （GWAS），包括初步筛选和进一步验证tion，以基因组差异之间的人类和猪黄色，旨在 确定与宿主相关的决定因素。 我们的 多重 GWAS分析发现了 6 个与宿主物种相关的共识显着 k-mer，为新的遗传证据区分人类 和猪<i>金黄色</i>。 最好的 k-mer 预测因子本身实现了 98.12% 的高分类准确率，并且具有类似于基于 SNP 的系统发育的极高分辨率，提供了一个非常简单的目标跨物种传播风险 金黄色。最终的 k-mer 模型显示， 的 90%金黄色葡萄球菌分离 来自农场工人预测为牲畜来源，这表明跨物种传播的风险很高。贝叶斯推断揭示了不同的跨物种传播方向， 人到猪的传播ST5 和猪到人的传播ST398。 我们的研究结果提供了一种简单且高精度的 k-mer 模型，用于跨物种传播风险<i>金黄色</i>。