Dysregulation of expression correlates with rare-allele burden and fitness loss in maize
收藏DataCite Commons2022-12-16 更新2024-07-13 收录
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http://datacommons.cyverse.org/browse/iplant/home/shared/commons_repo/curated/Kremling_maizeDiversityPanelRNAseq_2018
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资源简介:
The data under this DOI include gene expression counts from a diversity panel of maize collected from 7 tissues (Goodman-Buckler Diversity panel or '282 panel'). Also contained herein are the genotype subset used for rare variant burden tests in the associated publication and a set of phenotypic BLUPs for the diversity panel, which are also used in the associated publication. The data in this DOI were produced as part of the Kremling et al 2018 manuscript found here: doi:10.1038/nature25966. Additional details regarding these data can be found in readme in the directory and in the manuscript. This replaces DOI https://doi.org/10.25739/3ph0-x861
本DOI收录的数据包含从7种组织中采集的玉米古德曼-巴克莱(Goodman-Buckler)多样性群体(亦称“282群体”)的基因表达计数数据。本数据集还包含前述关联研究论文中用于罕见变异负荷检验的基因型子集,以及该多样性群体的表型最佳线性无偏预测(Best Linear Unbiased Prediction, BLUP)值,该值同样被应用于该关联研究论文中。本数据集所包含的数据是Kremling等人2018年发表的研究论文的组成部分,该论文的DOI为10.1038/nature25966。有关这些数据的更多详细信息,可查阅数据集目录下的README文件以及该研究论文。本数据集替代了原DOI:https://doi.org/10.25739/3ph0-x861。
提供机构:
CyVerse Data Commons
创建时间:
2022-12-16
搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集是一个玉米多样性面板的多组织RNAseq数据集,包含来自7个组织的基因表达计数数据,以及基因型子集和表型BLUPs,旨在研究稀有等位基因负担与基因表达失调及适应性丧失的关联。数据集基于Kremling等人2018年的研究,支持玉米遗传多样性和功能基因组学分析,并遵循公共领域许可证开放访问。
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