Transcriptional profiling of cortex from a mouse model of Huntington's disease (Q140) crossed with Msh3 heterozygous and homozygous mice [Msh3_cortex_6m]

Cortex was isolated from 6-month-old Msh3+/- and Msh3-/- mice crossed with the Q140 knock-in (KI) HD mice and their respective controls. Transcriptomic analysis (RNASeq) was performed on 6 genotypes: WT, Q140, Msh3+/-, Q140 X Msh3+/-, Msh3-/-, and Q140 X Msh3-/-, 7-9 replicates per genotype. RNASeq analysis was performed on samples from the cortex tissues of 6-month-old wild type, Q140, Msh3+/-, Q140 X Msh3+/-, Msh3-/-, and Q140 X Msh3-/- mice. N = 7-9 per group.本研究的大脑皮层组织分离自与携带Q140敲入（KI，Knock-in）等位基因的亨廷顿病（HD）模型小鼠及其对应野生型对照交配获得的6月龄Msh3杂合子（Msh3+/-）与纯合子敲除（Msh3-/-）小鼠。针对6种基因型小鼠开展转录组分析（RNASeq），涉及的基因型包括野生型（WT）、Q140、Msh3+/-、Q140×Msh3+/-、Msh3-/-以及Q140×Msh3-/-，每组设置7-9个生物学重复。本次RNASeq分析的样本均来自上述6种基因型6月龄小鼠的大脑皮层组织，每组样本量N=7-9。