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SCAN_B_Dataset_Cleaned|基因表达分析数据集|临床研究数据集

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github2020-09-26 更新2024-05-31 收录
下载链接:
https://github.com/JoshuaHarris391/SCAN_B_Dataset_Cleaned
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资源简介:
从GEO提取SCAN_B数据集,提取临床信息,并将其保存为RDa文件。GSE96058用于验证队列,GSE81540用于训练队列。

The SCAN_B dataset was extracted from GEO, with clinical information retrieved and saved as RDa files. GSE96058 was used as the validation cohort, while GSE81540 served as the training cohort.
创建时间:
2020-03-20
原始信息汇总

数据集概述

数据集名称

  • SCAN_B_Dataset_Cleaned

数据来源

  • 从GEO(Gene Expression Omnibus)提取的SCAN_B数据集。

数据处理

  • 提取临床信息。
  • 保存为RDa文件格式。

数据用途

  • GSE96058用于验证队列。
  • GSE81540用于训练队列。
AI搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
SCAN_B_Dataset_Cleaned数据集的构建过程涉及从GEO数据库中提取SCAN_B数据集,并进一步提取相关的临床信息。该数据集主要基于两个队列:GSE96058作为验证队列,GSE81540作为训练队列。数据经过处理后,以RDa文件格式保存,确保了数据的完整性和可重复性。
使用方法
使用SCAN_B_Dataset_Cleaned数据集时,研究人员可以通过加载RDa文件直接获取处理后的数据。该数据集适用于乳腺癌相关的基因表达分析、临床特征关联研究以及机器学习模型的开发与验证。通过结合训练和验证队列,用户能够全面评估模型的性能,并进一步探索乳腺癌的潜在生物标志物和治疗靶点。
背景与挑战
背景概述
SCAN_B_Dataset_Cleaned数据集源于基因表达综合数据库(GEO),旨在为乳腺癌研究提供高质量的基因表达数据。该数据集由GSE96058和GSE81540两个队列组成,分别用于验证和训练模型。其创建时间可追溯至相关研究的高峰期,主要研究人员或机构未明确提及,但其数据来源的广泛性和标准化处理使其在乳腺癌分子分型和预后预测领域具有重要影响力。通过整合临床信息与基因表达数据,该数据集为探索乳腺癌的分子机制及个体化治疗策略提供了重要支持。
当前挑战
SCAN_B_Dataset_Cleaned数据集在解决乳腺癌分子分型和预后预测问题时面临多重挑战。首先,基因表达数据的异质性和噪声问题使得数据清洗和标准化成为关键步骤,需确保数据的可靠性和一致性。其次,临床信息的提取与整合需要高度精确,以避免偏差影响研究结果。在构建过程中,研究人员还需克服数据来源的多样性和格式不统一的问题,确保不同队列数据的可比性。此外,如何从高维基因表达数据中提取有效特征并构建鲁棒的预测模型,也是该数据集应用中的一大挑战。
常用场景
经典使用场景
SCAN_B_Dataset_Cleaned数据集在乳腺癌研究领域中被广泛用于训练和验证机器学习模型。该数据集通过整合GEO数据库中的GSE96058和GSE81540两个队列数据,提供了丰富的临床信息和基因表达数据,使得研究人员能够在乳腺癌的早期诊断和预后预测中构建高精度的预测模型。
解决学术问题
该数据集解决了乳腺癌研究中基因表达数据与临床信息整合的难题,为研究人员提供了一个标准化的数据平台。通过该数据集,学者们能够更深入地探索乳腺癌的分子机制,识别潜在的生物标志物,并开发个性化的治疗方案,从而推动乳腺癌精准医学的发展。
实际应用
在实际应用中,SCAN_B_Dataset_Cleaned数据集被用于开发乳腺癌的诊断工具和预后评估系统。医疗机构可以利用该数据集训练的模型,辅助医生进行乳腺癌的早期筛查和风险评估,从而提高诊断效率和治疗效果,降低患者的医疗负担。
数据集最近研究
最新研究方向
在乳腺癌研究领域,SCAN_B_Dataset_Cleaned数据集的最新研究方向聚焦于利用高通量基因表达数据探索乳腺癌的分子亚型及其与临床预后的关联。该数据集整合了GSE96058和GSE81540两个队列的数据,为研究者提供了丰富的临床信息和基因表达谱。近年来,基于该数据集的研究揭示了乳腺癌异质性的分子机制,推动了精准医疗的发展。特别是在免疫治疗和靶向治疗领域,该数据集为识别潜在生物标志物和开发个性化治疗方案提供了重要支持。其影响不仅限于基础研究,还延伸至临床实践,为乳腺癌患者的个体化治疗决策提供了科学依据。
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