FIC

The predicted functional interactome of Caenorhabditis elegans database, FIC is a high-quality database of predicted functional interactions among genes. The functional interactions in FIC serve as a good reference interactome for GSLA to annotate differentially expressed genes for their potential functional impacts. In a case study, the FIC/GSLA system shows more comprehensive and concise annotations compared to other widely used gene set annotation tools, including PANTHER and DAVID.

FIC即秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans）预测功能互作组数据库，是一款收录基因间预测功能互作的高质量数据库。该数据库中的功能互作可作为GSLA的优质参考互作组，用于注释差异表达基因的潜在功能影响。在一项案例研究中，相较于PANTHER、DAVID等主流基因集注释工具，FIC/GSLA系统的注释结果更为全面且简洁。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

FIC是一个高质量的预测线虫功能相互作用组数据库，通过整合10个公共数据库中的六类证据构建，包含108,550个基因关联，覆盖约21.42%的线虫蛋白质-蛋白质相互作用。基于该网络，它提供了基因集连锁分析（GSLA）工具，用于注释同时变化基因的潜在功能影响。