Borealis DataVerse

The database provides a comprehensive set of predicted miRNA in the soybean cyst nematode (SCN) genome, identified using a species-specific miRNA discovery pipeline. It includes predicted gene targets within SCN and investigates cross-kingdom interactions with soybean mRNA. The predictions are validated through various control experiments and are available through an open repository.

本数据库收录了一套基于物种特异性微小RNA（miRNA）发现流程，在大豆孢囊线虫（SCN）基因组中鉴定得到的预测微小RNA全集。该数据集包含大豆孢囊线虫内源的预测基因靶标，并探究了其与大豆信使RNA（mRNA）之间的跨界相互作用。相关预测结果已通过多组对照实验完成验证，且可通过开放存储库获取。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集通过一个物种特异性的大豆胞囊线虫（SCN）miRNA发现流程，从SCN基因组中识别出1,565个高置信度miRNA，并预测了其在SCN内以及跨物种（大豆）的基因靶点。所有预测结果均经过验证，并通过开放存储库提供。