Drosophila Immunity Time-Course Data

可在此处找到用于本文所有结果的数据。该目录包含： GeneData.csv：包含 17 个时间点的 1735 个基因的时间基因表达测量值。测量值作为从第一个时间点开始的 $\log_2$-fold 变化提供。每个时间点对应的小时数在我们的 GitHub 存储库中的 R 脚本 3_Results.R 中定义。该数据集源自 Schlamp 等人收集的更大的基因表达数据集。 （2021 年）。 PriorMatrix.csv：一个 1735 x 1735 的先验邻接矩阵。每个条目是 0、1 或 NA，表示根据外部数据库，相应的两个基因之间的生物学关系不太可能、可能或未知。关于收集这些数据的更多细节可以在我们论文的第 4.1 节和附录 C 中找到。 R 脚本 3_Results.R 显示了如何读取这些 CSV 文件并将其用于我们的分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集名为'Drosophila Immunity Time-Course Data'，包含1735个基因在17个时间点的表达测量值（以对数倍变化表示）以及一个先验邻接矩阵，用于时间序列分析。它由康奈尔大学于2021年发布，源自Schlamp等人收集的数据，旨在支持基因动力学研究。