仿刺参基因组

国家海洋科学数据中心2025-09-13 更新2024-03-04 收录

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http://msdc.qdio.ac.cn/data/metadata-special-detail?id=1603040459108675586&otherId=1603040459528105986

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海参于2021年3月采自中国山东威海。采集体壁，立即在液氮中冷冻，并保存在−80°C。提取DNA，建库后利用二代illunima测序获得56.64G数据，利用Pacbio平台测序得到Hifi数据26.55G。利用Hifiasm进行PacBio Hifi reads数据的快速构建单倍型-从头组装，二代数据用于校正，最终构建出基因组全长669.81Mb，contig N50达到9.13Mbp。