ReMap

ReMap is an integrative analysis of Homo sapiens and Arabidopsis thaliana transcriptional regulators from DNA-binding experiments such as ChIP-seq, ChIP-exo, DAP-seq from public sources (GEO, ENCODE, ENA). The ReMap human atlas consists of 165 million (M) peaks from 1,135 transcription factors (TFs), transcription coactivators (TCAs) and chromatin-remodeling factors (CRFs). The ReMap Arabidopsis regulatory atlas consists of 2.6M peaks from 372 transcriptionnal regulators.

ReMap是一项针对智人（Homo sapiens）和拟南芥（Arabidopsis thaliana）转录调控因子的整合分析，其数据取自公开数据库（GEO、ENCODE、ENA）中的DNA结合类实验，包括染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、染色质免疫沉淀外显子组测序（ChIP-exo）以及DNA亲和纯化测序（DAP-seq）。ReMap人类图谱包含了来自1135个转录因子（TFs）、转录辅激活因子（TCAs）以及染色质重塑因子（CRFs）的1.65亿个测序峰。ReMap拟南芥调控图谱则涵盖了来自372个转录调控因子的260万个测序峰。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ReMap是一个整合性分析数据集，覆盖智人和拟南芥两种物种的转录调控因子数据，来源于公共数据库的ChIP-seq等DNA结合实验。人类图谱包含1.35亿个峰值和1,135个调控因子，拟南芥图谱包含260万个峰值和372个调控因子，具有大规模、跨物种和实验多样性的特点。