线粒体基因组组装和比较分析三密切相关的橡树

<i>栎</i>树（橡树）是北半球森林中生态基石和经济上至关重要的属。尽管基因组研究加深了我们对其核和叶绿体基因组的理解，但由于<i>栎</i><i> </i>粒体基因组（线粒体基因组）复杂的进化动力学，包括极端的大小变化、频繁的重排和反复的水平基因转移，对栎线粒体基因组（线粒体基因组）的研究仍然有限本研究介绍了使用<i>Q. engleriana</i>、<i>Q. kongshanensis</i> <i>Q. tungmaiensis</i>。组装揭示了不同的结构组织：<i>Q. engleriana</i> 和 <i>Q. kongshanensis</i> 有线粒体基因组各包含一个环状重叠群和一个线性重叠群，而 <i>Q. tungmaiensis</i>一个环状重叠群和两个线性重叠群组成。总线粒体基因组长度和蛋白质编码基因 （PCG） 确定为 445,351 bp （31 PCG），<i>Q. engleriana</i>为 538,610 bp （33 PCG），<i>山栎</i>为 479,938 bp （38 PCG），<i>迈栎</i>物种的 GC 含量相似 （45.6–45.9%）。比较分析确定了密码子使用偏差 （RSCU）、简单序列重复序列（SSR;分别为 154、176 和 160）和预测 RNA 编辑位点（每个物种 431-438 个）的变化。值得注意的是，rps12 中的 RNA 编辑<i>山栎</i>叶绿体衍生序列（MTPTs）分别占线粒体基因组的1.39%、1.79%和2.24%。基于线粒体 PCG 的系统发育重建<i>Q. kongshanensis</i> 和 <i>Q. tungmaiensis</i> 视为姐妹物种，这三者形成了一个与其他栎树分开的独特分支<i>栎</i>。这项研究提供了全面的有丝分裂基因组资源，对于阐明<i>栎</i>化生物学和支持种质发育至关重要。