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Conjunto de dados para análise de mutações nos segmentos genômicos do vírus Oropouche (OROV) entre 1955–2024 e variantes brasileiras de 2023–2024

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Zenodo2026-04-16 更新2026-05-26 收录
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Este conjunto de dados reúne arquivos de sequências genômicas e scripts utilizados em análises bioinformáticas para identificação de mutações nos segmentos genômicos do vírus Oropouche (OROV). As sequências utilizadas nas análises foram obtidas a partir do banco de dados público do National Center for Biotechnology Information (NCBI), incluindo registros depositados entre os anos de 1955 e 2024. Essas sequências foram organizadas de acordo com os três segmentos genômicos do vírus Oropouche (L, M e S). As sequências foram submetidas a alinhamento múltiplo utilizando o software MAFFT, executado em ambiente Linux (Ubuntu) por meio do Windows Subsystem for Linux (WSL). Após o alinhamento, scripts desenvolvidos em Python foram utilizados para identificar mutações presentes nas sequências analisadas. Esses scripts foram executados por meio do PowerShell e permitiram identificar mutações semelhantes e não semelhantes, bem como determinar as posições dessas mutações ao longo das sequências analisadas. A análise incluiu a avaliação de mutações acumuladas ao longo do tempo em sequências depositadas entre 1955 e 2024. Além da análise temporal, também foram incluídas sequências brasileiras do vírus Oropouche coletadas entre 2023 e 2024. Essas sequências foram comparadas com cepas de referência, incluindo a cepa BeAn19991 e a variante AM0088, permitindo identificar mutações presentes nas variantes recentes que não estavam presentes nas cepas de referência. Os arquivos disponibilizados neste dataset incluem: conjuntos de sequências utilizados nas análises bioinformáticas; scripts utilizados para identificação de mutações nos segmentos genômicos L, M e S; dados referentes à análise temporal de sequências de OROV depositadas entre 1955 e 2024 e dados referentes à análise comparativa de sequências brasileiras de 2023–2024 Este conjunto de dados foi gerado no contexto de uma dissertação de mestrado voltada ao estudo da evolução molecular e do acúmulo de mutações nos segmentos genômicos do vírus Oropouche.

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2026-04-16
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