MorphDB

MorphDB, a resource where MORPH-based candidate genes for large-scale functional annotations (Gene Ontology, MapMan bins) are integrated across multiple plant species. Besides a gene centric query utility, we present a comparative network approach that enables researchers to efficiently browse MORPH predictions across functional gene sets and species, facilitating efficient gene discovery and candidate gene prioritization. MorphDB is available at http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/morphdb/morphDB/index/. We also provide a toolkit, named "MORPH bulk" (https://github.com/arzwa/morph-bulk), for running MORPH in bulk mode on novel data sets, enabling researchers to apply MORPH to their own species of interest.MorphDB是一款整合了跨多个植物物种的、用于大规模功能注释（基因本体论（Gene Ontology）、MapMan功能分类单元（MapMan bins））的基于MORPH算法的候选基因的数据库资源。除提供以基因为中心的查询功能外，本资源还配套了一种比较网络分析方法，可帮助研究人员高效浏览不同功能基因集与物种间的MORPH预测结果，助力高效开展基因发现与候选基因优先级排序工作。MorphDB的访问地址为http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/morphdb/morphDB/index/。此外，我们还开发了一款名为"MORPH批量工具（MORPH bulk）"的工具包，其访问地址为https://github.com/arzwa/morph-bulk，支持在新数据集上以批量模式运行MORPH算法，使研究人员能够将MORPH应用于自身感兴趣的物种。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

MorphDB是一个整合了基于MORPH的候选基因功能注释（如基因本体和MapMan分类）的资源，覆盖多个植物物种，支持基因中心查询和功能类别查询。它提供比较网络方法，帮助研究人员高效浏览跨物种的MORPH预测，并包含SPARQL端点进行复杂查询，以促进基因发现和候选基因优先排序。