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Soil microbe community composition (DP1.10081.001)

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Mendeley Data2024-03-27 更新2024-06-28 收录
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资源简介:

This data product contains the quality-controlled laboratory data and metadata for NEON's soil bacterial, archaeal, and fungal community composition analysis derived from soil microbial sampling. Taxon tables are derived from the 16S and ITS marker gene sequencing data product, NEON.DP1.10108. The DNA sequence data are processed using standard bioinformatics software to generate taxonomic data. For additional details, see the user guide, protocols, and science design listed in the Documentation section in this data product's details webpage. Latency: The expected time from data and/or sample collection in the field to data publication is as follows, for each of the data tables (in days) in the downloaded data package. See the Data Product User Guide for more information. mcc\_soilSeqVariantMetadata\_16S: 730 mcc\_soilSeqVariantMetadata\_ITS: 730 mcc\_taxonTableLabSummary: 7

本数据产品包含经质量管控的实验室数据与元数据,源自美国国家生态观测站网络(National Ecological Observatory Network,NEON)基于土壤微生物采样开展的土壤细菌、古菌及真菌群落组成分析工作。分类数据表源自16S与ITS标记基因测序数据产品NEON.DP1.10108。DNA序列数据通过标准生物信息学软件处理后生成分类学数据。如需获取更多详情,请参阅本数据产品详情网页"文档"板块中列出的用户指南、实验方案及科学设计文档。发布延迟:本下载数据包内各数据表从野外数据和/或样本采集至正式发布的预期耗时(单位:天)如下,详细信息请参阅《数据产品用户指南》。 mcc_soilSeqVariantMetadata_16S:730 mcc_soilSeqVariantMetadata_ITS:730 mcc_taxonTableLabSummary:7

创建时间:
2023-06-28
搜集汇总
数据集介绍
Soil microbe community composition (DP1.10081.001) 数据集图片
背景与挑战
背景概述
该数据集提供了2014年至2018年期间,从美国国家生态观测网络(NEON)陆地站点采集的土壤微生物群落组成数据,包括古菌、细菌和真菌类群的计数和相对丰度,基于16S和ITS标记基因测序分析。数据集已被新版本'Soil microbe community taxonomy (DP1.10081.002)'取代,属于历史发布版本,适用于研究土壤微生物多样性和群落动态。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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