Nphos

Nphos has collected 11,710 experimentally verified N-phosphosites of 7,344 proteins from 39 species which is used to share up-to-date information on protein N-phosphorylation. Upon these substantial data, we characterized the sequential and structural features of protein N-phosphorylation. Moreover, we chose and optimized gradient boosting decision tree (GBDT) models to predict three types of human N-phosphorylation.Nphos 收集了来自39个物种的7344种蛋白质的11710个经实验验证的N-磷酸化位点（N-phosphosites），该数据集旨在共享蛋白质N-磷酸化领域的最新研究信息。基于上述海量实验数据，我们对蛋白质N-磷酸化的序列特征与结构特征进行了系统表征。此外，我们选取并优化了梯度提升决策树（gradient boosting decision tree，GBDT）模型，用于预测三类人类N-磷酸化修饰。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Nphos是一个专门收集蛋白质N-磷酸化位点的数据集，包含11,710个实验验证的位点，覆盖7,344种蛋白质和39个物种，用于促进蛋白质N-磷酸化的最新信息共享和研究。该数据集不仅提供了序列和结构特征分析，还基于梯度提升决策树模型开发了人类N-磷酸化类型的预测工具，具有实验验证全面、物种覆盖广泛和预测功能实用的特点。