珠江口和北海香港牡蛎重测序数据
收藏国家海洋科学数据中心2025-08-30 更新2024-03-04 收录
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http://msdc.qdio.ac.cn/data/metadata-special-detail?id=1737722612567597057&otherId=1737722612697620481
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资源简介：
末端修复、A尾化、连接成双端接头，并通过500碱基插入物进行PCR扩增以构建文库。测序使用Hiseq X10 PE150（Illumina）生成150碱基的双端读取。使用Bowtie2默认参数将高质量reads比对到香港牡蛎的参考基因组序列。BAM文件导入Samtools进行参考索引建立、格式转换和读取排序。
(序列数据已上传至NCBI submission：
SRR23012948,SRR23012950,SRR23012949,SRR23012957,SRR23012955,SRR23012954,SRR23012953,SRR23012951,SRR23012952,SRR23012956,SRR23012958
SRR22963607,SRR22963606,SRR22963605,SRR22963593,SRR22963599,SRR22963598,SRR22963596,SRR22963594,SRR229
)
