DarkHorse

DarkHorse is a bioinformatic method for rapid, automated identification and ranking of phylogenetically atypical proteins on a genome-wide basis. It works by selecting potential ortholog matches from a reference database of amino acid sequences, then using these matches to calculate a lineage probability index (LPI) score for each genome protein.DarkHorse是一款可在全基因组范围内快速、自动化识别并排序系统发育异常蛋白的生物信息学方法。其工作原理为：首先从氨基酸序列参考数据库中筛选潜在的直系同源匹配结果，随后利用这些匹配结果为每个基因组蛋白计算谱系概率指数（lineage probability index，LPI）得分。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

DarkHorse 是一个用于快速、自动识别和排名系统发育非典型蛋白质的生物信息学算法。它通过从参考数据库中选择潜在直系同源匹配来计算谱系概率指数（LPI）分数，适用于分类新类群序列和识别水平基因转移候选。