ENTRAF

ENTRAF provides a centralized, web-based location to organize information about 1784 DNA-binding transcription factors with experimental evidence, from bacteria and archaea organisms, collected from Swissprot, PDB, RegulonDB, RegulomeDB, CollecTF, and DBTBS. From these, 1712 TFs have been characterized in 29 bacterial orders, such as Gammaproteobacteria, Bacilli, and Actinomycetota; and 72 TFs in ten archaeal orders, as Thermoprotei and Thermococci. ENTRAF version 2.0 contains 2787 references.ENTRAF 是一款基于网页的中心化资源平台，用于归集来自细菌与古菌的1784个经实验验证的DNA结合转录因子（DNA-binding transcription factors）的相关信息，相关数据采集自Swiss-Prot、PDB、RegulonDB、RegulomeDB、CollecTF及DBTBS数据库。其中1712个转录因子已在29个细菌类群中完成特征注释，所涉类群包括γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）、芽孢杆菌纲（Bacilli）与放线菌门（Actinomycetota）；另有72个转录因子隶属于10个古菌目，涵盖热变形菌纲（Thermoprotei）与热球菌纲（Thermococci）。ENTRAF 2.0版本共收录2787篇参考文献。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ENTRAF是一个集中式数据库，专门整理细菌和古菌中具有实验证据的DNA结合转录因子信息，共收录1784个转录因子，涵盖29个细菌目和10个古菌目。其2.0版本包含2787篇参考文献，数据来源于Swissprot、PDB等多个权威数据库。