sORFdb

sORFdb is a taxon-independent repository of high-quality bacterial short open reading frames (≤100 aa) and their encoded small proteins. It integrates curated sequences, Hidden-Markov-Model family profiles, taxonomic distribution and physicochemical annotations, offering specialised search, visualisation and bulk-download functions for comparative genomics and small-protein discovery.sORFdb是一个不依赖分类群的高质量细菌短开放阅读框（short open reading frames，≤100个氨基酸，aa）及其编码小蛋白的资源库。该库整合了经人工甄选整理的序列、隐马尔可夫模型（Hidden-Markov-Model）家族特征谱、分类分布信息与理化性质注释，可为比较基因组学（comparative genomics）研究及小蛋白发现提供专业化检索、可视化与批量下载功能。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

sORFdb是一个专门针对细菌中短开放阅读框(sORFs)和小蛋白及其功能的数据库，整合了高质量基因组和蛋白质数据，并补充了理化性质等信息。它提供隐藏马尔可夫模型和搜索浏览功能，旨在提升小蛋白的可发现性，支持其识别与注释。